在黨和國家大力扶持民族醫藥發展政策的指引下，黔東南苗族侗族自治州的苗族、侗族結束了苗族侗族醫藥無文字記載的歷史，該州民族醫藥研究所20多年研發民族醫藥已取得碩果，并成立黔東南州民族醫藥研究所附屬苗醫醫院，使貴州省有了首家公立的非營利性的苗醫醫院。

為發掘、總結、提高黔東南民族醫藥的理論研究、臨床研究及成果的推廣與轉化，保護、繼承、創新和發揚黔東南民族醫藥，使之與現代醫學結合，營造現代、科學、國際和大眾的苗、侗族醫藥學體系平臺，在黔東南州民族醫藥研究所的努力下，經州衛生局批準，該研究所2009年8月成立黔東南州民族醫藥研究所附屬苗醫醫院，成為貴州省內一所公立苗醫醫院，這也是省內一所少數民族公益性醫院。

2010年，為滿足人民群眾看病就醫的需求，在黔東南州人民政府、衛生局、中醫院等部門的支持下，黔東南州民族醫藥研究所附屬苗醫醫院下大力量擴大發展規模，增加建設投資，完善醫院設施。目前，該院設有苗醫專科、侗醫專科、蜂療專科、婦科、牙科、針灸按摩專科等專病專科，建有專科門診及治療室、病房、化驗中心、以及中、西藥房等;臨床運用針刺、刮痧、蜂毒、藥敷、手法推拿、按摩、熏蒸、藥浴等民族醫藥特色療法，治療風濕、類風濕、頸肩腰腿痛、婦科病、骨髓炎、腎結石等疾患取得顯著療效;研究所20多年來由民族藥物驗方研制出十多種民族藥及自用制劑，在臨床中應用取得了顯著的治療效果，“楓荷除痹液”已獲得國家批準文號并投入了生產。苗、侗民族醫藥特色鮮明，簡便實用、療效好、經濟廉價，使當地農民看得起病，深受廣大人民群眾的歡迎，也引來了更多的患者。

該研究所所長兼附屬苗醫醫院院長郭偉偉表示，2011年，醫院將進一步加強基礎設施的建設，增加建立住院部和病房、改善設施，建立中藥制劑室;加強苗醫、侗醫等民族醫特色專病專科的建設，總結梳理驗證苗醫、侗醫等民族醫藥優勢病種診療方案，在農村和城市社區衛生醫療機構推廣使用;在農村和城市社區推廣經臨床使用證明安全、有效、規范、經濟、實用、便捷、易學的苗醫藥、侗醫藥等民族醫藥適宜技術，提高服務能力、服務質量和工作效率。同時，還要對黔東南的養生保健、中藥膳食、針灸按摩、刮痧、拔罐等民族醫藥特色進行合理的開發和利用，發揮苗醫藥、侗醫藥等民族醫藥在防病、強身健體等多方面的優勢和作用。編寫教材、開展民間民族醫學的學習培訓，提高苗族醫藥、侗族醫藥和廣大民間民族醫臨床水平和科學技術水平。

今后，醫院還要發揮苗醫藥、侗醫藥在重大疾病防治中的作用，針對目前發病率、致殘率、致死率較高的心腦血管疾病、代謝性疾病、病毒、細菌感染性疾病、腫瘤等重大疾病，篩選、優化診療方案，通過苗醫、侗醫專科專病建設，形成苗醫藥、侗醫藥臨床診療方案、指南，并加以推廣;要總結苗醫藥、侗醫藥防治傳染病的經驗，總結苗醫藥、侗醫藥治療外傷的經驗;建立苗醫藥、侗醫藥應對突發公共衛生事件的參與機制，提高應對突發公共衛生事件的能力。